آيت اللَّه سيدروح اللَّه خاتمي در سال 1285 ش (1324 ق) در اردكان يزد به دنيا آمد.
پس از آن که مقدمات علوم را در زادگاهش فراگرفت، راهی اصفهان شد و در آنجا از محضر استادانی همچون میرزا علی آقا شیرازی، سیدمحمد و سیدعلی نجف آبادی و حاج آقا رحیم ارباب استفاده برد. آیت اللَّه خاتمی همچنین سالیانی در حوزه علمیه قم در دروس آیت اللَّه شیخ عبدالکریم حائرییزدی شرکت کرد و به مدارج والای علمی و اخلاقی دست یافت. وی از آن پس ساکن اردکان شد و به تدریس و ارشاد مردم همت گماشت. آیت اللَّه خاتمی به عنوان روحانی شاخص منطقه، نقش مهمی در حرکت انقلابی مردم بر ضدرژیم پهلوی داشت و مورد توجه خاص حضرت امام خمینی واقع بود. این عالم دینی پس از شهادت آیت اللَّه صدوقی، سومین شهید محراب، از طرف حضرت امام، به نمایندگی آن حضرت و امامت جمعه یزد منصوب شد و تا پایان عمر شریف خود، در این سنگر خدمت نمود. سرانجام آیت اللَّه سیدروح اللَّه خاتمی، در ۵ آبان ۱۳۶۷ ش برابر با ۱۵ ربیع الاول ۱۴۰۹ ق در ۸۲ سالگی دار فانی را وداع گفت و پس از تشییعی با شکوه، در زادگاهش مدفون گردید.